Климат Абакана обусловлен его географическим расположением. Столица Хакасии расположена в Минусинской котловине, удаленной от каких-либо океанов и морей и со всех сторон окруженной горами: с севера — хребтом Арга, с востока и юга — Саянами, с запада — Алатау. Все это способствует тому, что в котловину попадает мало влаги, в результате в центре тайги образовались степная и лесостепная зоны. В период антициклонов, обычных для зимних сезонов, холодный воздух стекает в котловину, где выхолаживается и застаивается, остывая иногда до -40° С.
Начало череды зимних дней приходится на последние дни октября, в следующем месяце устанавливается ясная погода со стабильно отрицательными температурами. Воздух зимой остывает обычно до -15…-18° С, нередки случаи, когда стоит мороз до -30° С. Зимой обыкновенно формируются погодные условия без ветра, с незначительными осадками в виде снега. Метели начинаются лишь в феврале, их среднее количество — 5 раз в год. Из-за расположения в котловине и безветренной погоды зимой над городом стоит смог, поскольку дома частного сектора, которых в городе много, отапливаются углем и мазутом. Снег начинает сходить в конце марта, его мало, поэтому тает он быстро. Однако настоящая весна приходит на городские улицы в середине апреля, начинаются интенсивные ветры. Возвраты холодов бывают и в мае, кратковременные заморозки случаются в начале июня, считающегося уже летним месяцем. Весной город необыкновенно хорошеет — все кустарники, деревья, травянистые растения, которыми так богат Абакан, зеленеют и расцветают. Летом обычен нагрев воздуха до +17…+20° С, но наблюдаются периоды, обычно в июле, когда стоит жара до +30° С и больше. За июнь-июль выпадает почти половина осадков от общегодовой нормы в 323 мм, часто они проливаются ливневыми дождями с грозами. Иногда в окрестностях города наблюдаются пыльные бури. В августе, относящемся к летнему периоду, отмечаются первые признаки осени: тепло летних дней может смениться ночью отрицательными температурами. После летнего затишья осенью возобновляются ветры, зачастую его порывы достигают 15 м/сек. В сентябре короткая осень Абакана заканчивается.
На климат города http://abakan.pogoda24.org/ локальное влияние оказывает Красноярское водохранилище: в городских районах, расположенных рядом с ним, часто наблюдаются туманы. Абакан стоит в зоне сейсмической активности, регулярно вблизи города происходят мелкие колебания в земной коре. Последнее сильное землетрясение произошло в 2013 году в 50 км южнее города, интенсивность сотрясения составила 6 баллов по 12-бальной системе.